Análisis de comunidades biológicas en suelos de plantaciones de piña en la Región Huetar Norte, como opción para controles alternativos de patologías

Abstract

El desconocimiento de las comunidades biológicas que habitan los suelos, especialmente las de los suelos tropicales, es una limitante para gestionar y aprovechar los servicios ecológicos que éstas brindan a los agroecosistemas. En esta investigación se logró contribuir al conocimiento de las comunidades biológicas de los suelos en plantaciones piñeras en la Región Huetar Norte de Costa Rica. Se obtuvieron muestras de 15 plantaciones de piña y 11 parches de bosques o plantaciones de árboles cerca de ellos. En primera instancia, se logró obtener un protocolo de extracción de ADN ambiental a partir de muestras de suelo cultivado y no cultivado de las principales regiones piñeras del país, base para cualquier estudio metagenómico. El protocolo demostró ser adecuado para posteriores procesos de secuenciación de ADN. Los análisis bioinformáticos de la riqueza de especies en el microbioma del suelo, logró demostrar que existen pequeños cambios en la estructura de las comunidades, sin embargo, existen algunas poblaciones que fluctúan según el uso del suelo. Paralelamente, se demostró que la diversidad biológica de nematodos está relacionada con la calidad del suelo, al menos a nivel de género. Helicotylenchus fue el género más abundante en piña, mientras que Discocriconemella dominó en bosques y plantaciones de árboles. Toda la información analizada demuestra que el uso del suelo genera cambios en su estructura y composición, lo cual genera variaciones también en la presencia de nematodos, hongos y bacterias. El impacto y uso de dicha información, permitiría a futuro generar estudios más específicos, que permitan esclarecer cuáles comunidades biológicas podrían ser más susceptibles a cambios, ser beneficiosas o incluso tener algún efecto negativo al cultivo.