This permitted to calculate the annual percentage change rate using the formula proposed by Puyravaud (2003). Software that allows both vectorial and raster formats was used, such as: ArcView 3.3, ArcGis 9.3 and FRAGSTATS 3.3. The measurements of fragmentation calculated by software FRAGSTATS 3.3 were: remnant area, number of patches (NP), mean nearest neighbor distance (MNN) and patch density (PD). During the period 1997-2000 9 139 hectares were deforested, 54,8% was concentrated in the UF 3a (Tortuguero plains, lowlands), while in the period 2000-2005, 23 699 hectares were cut, of which 18,6% was concentrated in the UF 3a (Tortuguero plains, lowlands), nevertheless it appeared recovery of forest cover. Only during the period 2000-2005 were identified processes of loss and recovery of forest cover simultaneously.Se estudió el grado de fragmentación de la cobertura forestal de Costa Rica en las Unidades Fitogeográficas (UF) durante tres años: 1997, 2000 y 2005. Se calculó la tasa porcentual anual de cambio utilizando la fórmula propuesta por Puyravaud (2003). Se utilizó software que permitió trabajar tanto en formato vectorial como raster, tal como ArcView 3.3, ArcGis 9.3 y FRAGSTATS 3.3. Las métricas de fragmentación calculadas por el software FRAGSTATS 3.3 fueron área remanente, número de parches (NP), distancia media al vecino más cercano (MNN) y densidad de parches (PD). Durante el período 1997-2000 se deforestaron 9139 hectáreas, de las cuales el 54,8% se concentró en la UF 3a (llanuras de Tortuguero, tierras bajas), mientras que durante el período 2000-2005 se deforestaron 23699 hectáreas, de las cuales el 18,6% se concentró en la UF 3a (llanuras de Tortuguero, tierras bajas). Sin embargo se presentó recuperación de la cobertura forestal. Solamente durante el período 2000 - 2005 fueron detectados procesos de pérdida y recuperación de la cobertura forestal en forma simultánea.