Identificación de los principales hongos asociados a la caída prematura de la fruta en cítricos y evaluación de cuatro fungicidas para su manejo en una finca productora de naranja ubicada en Brasilia, Alajuela, Costa Rica
Abstract
El cultivo de naranja es uno de los de mayor relevancia a nivel mundial. En el caso de Costa
Rica, es un cultivo de importancia económica y social al ser una de las principales fuentes de
trabajo y sostén de las familias en la región Chorotega del país. Además, al ser un cultivo
perenne ofrece diversas ventajas como control de la erosión, mejora el microclima, captura y
almacena carbono. Enfrenta diversos retos dentro de los cuales destaca el control de la caída
prematura de la fruta, ocasionada por el hongo Colletotrichum. Esta enfermedad es de gran
relevancia porque reduce la productividad desde las primeras etapas. Actualmente, debido al
cambio climático, se producen diversas floraciones al año ocasionando un aumento de inóculo
en campo lo que dificulta el control de la enfermedad; aunado a una limitación en fungicidas
disponibles aprobados para el cultivo. El manejo de enfermedades debe ir más allá de cuidar la
salud de la plantación, debe además buscar proteger los intereses en el futuro. En el diseño de
planes de manejo se debe considerar el impacto de las prácticas a implementar en la
sostenibilidad del negocio incluyendo la rentabilidad y el ambiente. Por lo tanto, es necesario
dirigir esfuerzos en investigación que promuevan diseñar planes de manejo que permitan
ajustarse para enfrentar las condiciones actuales en aras de lograr una producción sostenible.
El objetivo del presente trabajo fue identificar los hongos asociados a la caída prematura de la
fruta (Colletotrichum spp.) en una finca productora de cítricos ubicada en Brasilia, Alajuela,
Costa Rica y evaluar su control a través de fungicidas. La investigación se llevó a cabo en tres
etapas. En una primera etapa se obtuvieron aislamientos de diferentes tejidos florales de
naranja, de los cuales seis aislamientos de hongos fueron identificados vía PCR.
Posteriormente, en una segunda etapa se evaluó la eficacia in vitro, mediante dos ensayos, de
los fungicidas tebuconazol, pyraclostrobin, difenoconazol y ferbam sobre dos aislamientos de
Colletotrichum. Se realizó un primer ensayo en placas multipozo evaluando el grado de
inhibición del crecimiento micelial y un segundo ensayo en placas Petri determinando el
porcentaje de efectividad de cada fungicida. En una tercera etapa se evaluó la efectividad en
campo durante los meses junio-agosto del 2021 de los fungicidas solos y en mezcla. Los
resultados obtenidos fueron los siguientes. Se identificó Colletotrichum abscissum en pétalos
con síntomas de la enfermedad de la caída prematura de la fruta y C. gloeosporoides en
cálices persistentes. La predominancia de C. abscissum tiene implicaciones directas en el
manejo de la enfermedad debido a que la agresividad es mayor al ser causada por C.
abscissum, en relación con C. gloeosporioides. No se obtuvo crecimiento micelial en pétalos sin
síntomas, esto podría deberse a que Colletotrichum presenta únicamente una fase necrotrófica
en pétalos de flores de naranja. Se identificó Fusarium en pedicelos que permanecieron tras la
caída de flores, con dos coincidencias; F. incarnatum y F. keratoplasticum. Los fungicidas con
mejor efectividad in vitro fueron los triazoles, tebuconazol y difenoconazol, en ese orden. El
pyraclostrobin demostró poca eficacia sobre la inhibición de ambos aislados; se recomienda
realizar una evaluación de efectividad in vitro empleando inhibidores de la enzima oxidasa
alternativa (AOX) como enmienda para valorar su efectividad. El pyraclostrobin mostró el mejor
combate de la enfermedad, determinado en el mayor porcentaje de cuaje y presentando menor
incidencia de cálices persistentes. El ferbam resultó poco eficaz en las pruebas in vitro. En la
evaluación en campo al ser aplicado en mezcla con fungicidas sistémicos permitió aumento en
porcentaje de cuaje y una disminución en incidencia de cálices persistentes. Estos resultados,
validan el ferbam como alternativa de control a incluir en el diseño de planes de manejo de
Colletotrichum spp asociado a caída prematura de la fruta. Se recomienda realizar una
evaluación de distintas mezclas de sistémicos en comparación a las mezclas de sistémicos con
ferbam, para establecer el correcto sistema de rotación a emplear, junto con evaluaciones de
residuos para determinar el número de ciclos a incluir Orange cultivation is one of the most relevant worldwide. In the case of Costa Rica, it is a crop of
economic and social importance as it is one of the main sources of work and support for families in
the Chorotega region of the country. In addition, being a perennial crop, it offers several advantages
such as controlling erosion, improving the microclimate, capturing and storing carbon. It faces
several challenges within which it highlights the control of the premature fall of the fruit, caused by
the fungus Colletotrichum. This disease is of great relevance because it reduces productivity from
the first stages. Currently, due to climate change, several blooms are produced each year, causing
an increase in inoculum in the field, which makes it difficult to control the disease; combined with a
limitation on approved fungicides for cultivation. The management of diseases must go beyond
taking care of the health of the plantation, it must also seek to protect the interests in the future. In
the design of management plans, the impact of the practices to be implemented on the sustainability
of the business, including profitability and the environment, must be considered. Therefore, it is
necessary to direct research efforts that promote the design of management plans that allow
adjustment to face current conditions to achieve sustainable production (Rangel & Gonzáles, 2022).
The objective of this work was to identify the fungi associated with premature fruit drop
(Colletotrichum spp.) in a citrus producing farm located in Brasilia, Alajuela, Costa Rica and to
evaluate their control through fungicides. The investigation was carried out in three stages. In a first
stage, isolates of different orange floral tissues were obtained, of which six fungal isolates were
identified via PCR. Subsequently, in a second stage, the in vitro efficacy of the fungicides
tebuconazole, pyraclostrobin, difenoconazole and ferbam on two Colletotrichum isolates was
evaluated by means of two trials. A first test was carried out in multiwell plates, evaluating the
degree of mycelial growth inhibition, and a second test in Petri dishes, determining the percentage of
effectiveness of each fungicide. In a third stage, the effectiveness in the field was evaluated during
the months of June-August 2021 of the fungicides alone and in mixture. The results obtained were
the following. Colletotrichum abscissum was identified in petals with symptoms of premature fruit
drop disease and C. gloeosporoides in persistent calyxes. The predominance of C. abscissum has
direct implications in the management of the disease since its aggressiveness is greater when it is
caused by C. abscissum, in relation to C. gloeosporioides. No mycelial growth was obtained in
petals without symptoms, this could be since Colletotrichum only presents a necrotrophic phase in
orange flower petals. Fusarium was identified in pedicels that remained after flower fall, with two
coincidences: F. incarnatum and F. keratoplasticum. The fungicides with the best in vitro
effectiveness were the triazoles, tebuconazole and difenoconazole, in that order. Pyraclostrobin
showed little efficacy on the inhibition of both isolates; It is recommended to carry out an in vitro
effectiveness evaluation using inhibitors of the alternative oxidase enzyme (AOX) as an amendment
to assess its effectiveness. Pyraclostrobin showed the best fight against the disease, determined in
the highest percentage of fruit set and presenting a lower incidence of persistent calyxes. Ferbam
was poorly effective in in vitro tests. In the field evaluation, when applied in a mixture with systemic
fungicides, it allowed an increase in the percentage of fruit set and a decrease in the incidence of
persistent calyxes. These results validate ferbam as a control alternative to include in the design of
management plans for Colletotrichum spp associated with premature fruit drop. It is recommended
to carry out an evaluation of different systemic mixtures compared to systemic mixtures with ferbam,
to establish the correct rotation system to be used, together with residue evaluations to determine
the number of cycles to include.
Description
Tesis (Maestría en Ciencia y Tecnología para la Sostenibilidad) Instituto Tecnológico de Costa Rica. Universidad Nacional de Costa Rica. Universidad Estatal a Distancia de Costa Rica. Doctorado en Ciencias Naturales para el Desarrollo, 2023.