Medicinal plants are part of world culture since immemorial times, but studies about the processes of secondary-metabolites synthesis, are insufficient. Therefore, transcriptomics and metabolomics technologies have gained credibility as more accurate biologically options for characterization of plant material, including very specific studies in terms of gene expression. This research aimed to search in databases, glycosides synthesis pathway related genes in Stevia rebaudiana, and the analysis of promoter regions, to establish relationships between DNA interaction sites and transcription regulation proteins in Arabidopsis thaliana. A sample of mRNA was sequenced from S. rebaudiana leaf and was aligned against gene sequences reported. Some of the selected genes were found underrepresented in the transcriptome, which would signal the controlled production of glycosides regulated by certain genes; this is consistent with the correlative studies that have shown the importance of SrCPPS, SRKs, SrKO genes in regulating the content of glycosides. The use of these results involves the study of the stimuli to transcription factors that regulate gene expression in the metabolic pathway of interest, as the response to water stress and high levels of salinity.Las plantas medicinales forman parte de la cultura de los pueblos desde tiempos inmemorables, pero los estudios sobre los procesos de síntesis de sus metabolitos secundarios son insuficientes. Por tanto, las tecnologías de transcriptómica y metabolómica han ganado credibilidad como opciones biológicamente más certeras para la caracterización del material vegetal, incluyendo estudios muy específicos en términos de expresión génica. Esta investigación tuvo por objetivo la búsqueda de genes de ruta de síntesis de glicósidos en Stevia rebaudiana, así como el análisis de regiones promotoras, para establecer relaciones entre sitios de interacción en el ADN y proteínas de anclaje reguladoras de la transcripción de Arabidopsis thaliana. Se secuenció una muestra de ARN mensajero a partir de tejidos de hoja de S. rebaudiana y se alineó contra las secuencias génicas reportadas. Algunos de los genes seleccionados se encontraron menos representados en el transcriptoma, lo que podría ser un indicador de la producción controlada de glicósidos regulada por ciertos genes; esto concuerda con los estudios correlativos, que han puesto de manifiesto la importancia de los genes SrCPPS, SrKS y SrKO en la regulación del contenido de glicósidos. El aprovechamiento de estos resultados involucra el estudio de los estímulos a los factores de transcripción que regulan la expresión génica dentro de la ruta metabólica de interés, como la respuesta al estrés hídrico y altos niveles de salinidad.